Software Engineer - Royer Group

El Chan Zuckerberg Biohub San Francisco (CZ Biohub SF) es un instituto de investigación sin fines de lucro, pionero e independiente. Unimos la experiencia de Stanford, UC Berkeley y UC San Francisco para impulsar la tecnología innovadora y los descubrimientos revolucionarios. Nuestra misión es apoyar a ingenieros de primer nivel, científicos de datos e investigadores biomédicos para descubrir los mecanismos de las enfermedades y desarrollar diagnósticos y terapias revolucionarias. Nuestros valores enfatizan la excelencia académica, la innovación disruptiva, la ingeniería práctica, la colaboración, la comunicación abierta, la inclusividad y la igualdad de oportunidades para todos.

• Abordamos desafíos científicos significativos que los entornos convencionales no pueden tratar.
• Empoderamos a los investigadores individuales para que persigan sus ideas más audaces e innovadoras.
• Nuestras tecnologías facilitan los esfuerzos de investigación tanto para científicos como para clínicos dentro de nuestras instituciones asociadas y a nivel mundial.

En CZ Biohub SF, la diversidad de pensamiento, ideas y perspectivas es primordial. Nos dedicamos a fomentar un ambiente inclusivo donde cada miembro del equipo se sienta valorado y sus contribuciones sean reconocidas.

Como Ingeniero de Software I, serás responsable de mantener un conjunto de software de vanguardia para el almacenamiento, procesamiento, análisis y visualización de imágenes a gran escala. Utilizando las últimas tecnologías y bibliotecas, como napari, Cupy, Dask, Zarr, scikit-image, PyTorch, y más, desempeñarás un papel vital en nuestras iniciativas de investigación. Los candidatos ideales tendrán familiaridad con el software de seguimiento celular de código abierto Ultrack, un sólido entendimiento de la microimagen multidimensional de desarrollo, particularmente en microscopía de hoja de luz, y una pasión por el software de código abierto y la construcción de comunidades.

• Innovar y desarrollar métodos altamente eficientes para la segmentación y seguimiento de células en 3D en datos de microscopía de hoja de luz a gran escala.
• Escribir y publicar artículos de investigación en revistas y conferencias de primer nivel.
• Crear, documentar y mantener software de código abierto impactante para el análisis de imágenes de conjuntos de datos de microscopía de hoja de luz.
• Colaborar con equipos multifuncionales en proyectos de alto nivel en CZ Biohub.
• Asistir a equipos tanto internos como externos en la utilización efectiva de nuestras herramientas de software.
• Fortalecer los lazos con proyectos upstream, incluyendo napari, zarr, dask y scikit-image.
• Colaborar dentro del ecosistema de CZ, incluyendo CZI, CZII, CZB Chicago y CZB Nueva York.

Esenciales

• Maestría en Ciencias de la Computación (completada o cerca de completarse), idealmente especializándose en Visión por Computador, Aprendizaje Profundo e IA.
• Más de 3 años de experiencia en codificación y desarrollo de pipelines de procesamiento y análisis de imágenes.
• Más de 6 años de experiencia en ingeniería de software.
• Dominio de conceptos y herramientas de desarrollo de software profesional.
• Experiencia programando en lenguajes como C/C++, Java, Python, OpenCL y CUDA.
• Experiencia en la gestión de conjuntos de datos de múltiples terabytes.
• Experiencia en imagen fluorescente.
• Historial comprobado de escritura de manuscritos académicos.
• Familiaridad con bibliotecas como Numpy, SciPy, Dask, Cupy, Numba, scikit-image y napari.
• Expertise en procesamiento de imágenes para microscopía y diseño de modelos de aprendizaje profundo en Tensorflow o PyTorch.
• Experiencia de investigación independiente relevante.

Por favor, nota que todos los empleados, contratistas y pasantes en el Chan Zuckerberg Biohub deben presentar prueba de vacunación completa contra el COVID-19, incluyendo una dosis de refuerzo si son elegibles, antes de su fecha de inicio. Se disponen excepciones para individuos debido a discapacidades o creencias religiosas sinceramente mantenidas.

Rango salarial anual: $92,000 - $126,500

• Recursos