Інженер-біоінформатик з обробки даних II

Висновок про компанію:

Arana Biosciences - це одна з недавно заснованих компаній завдяки рушійному двигуну створення підприємств Flagship Pioneering, який став основою для таких компаній, як Moderna Inc. та Indigo Ag. З моменту заснування Flagship у 2000 році, вона породила та підтримувала майже 100 наукових підприємств, виручивши загальну суму більше ніж 19 мільярдів доларів, отримавши понад 500 патентів та провівши більше 50 клінічних випробувань нових терапевтичних агентів. Arana Biosciences поєднує останні прориви в молекулярній та рослинній біології для розробки новітньої платформи технологій, яка пропонує адаптивні, цільові та стійкі рішення в секторі сільського господарства.

Інженер з обробки даних II, Біоінформатика

Основні обов'язки:  

• Проектувати, розробляти та адмініструвати системи баз даних для самостійного доступу біологів до даних.
• Автоматизувати процеси отримання та зберігання даних в електронних лабораторних записах (ELN), таких як Benchling.
• Співпрацювати з командою вчених для автоматизації процесів аналізу даних та створення інфраструктури даних.
• Розробляти, вносити свій вклад та активно поширювати стандарти та практики інженерії даних, формуючи повторювані шаблони та фреймворки, а також ефективне використання хмарних сервісів та інструментів.
• Повідомляти наукову команду та вище керівництво про отримані результати та прогрес.

Мінімальні вимоги 

• Бакалавр або магістр комп'ютерних наук або суміжного напрямку та 3+ років роботи в середовищі промисловості.
• Значний досвід роботи з технологіями, архітектурою та управлінням базами даних.
• Володіння скриптовими мовами, такими як Python, R, SQL, та інструментами контролю версій.
• Розуміння процесу розробки та створення проектів інтерфейсу користувача.
• Практичні навички роботи з сервісами AWS, включаючи EC2, S3, RDS, FSx Lustre, Athena, Glue, Lambda, Batch.
• Розуміння циклу життя програмного забезпечення, включаючи найкращі практики, такі як перегляд коду, тестування модулів/інтеграції та документація.
• Здатність проектувати та запроваджувати бекенд-моделі за допомогою логіки та точок кінця API для складних наукових процесів/сутностей (наприклад, Benchling).
• Адаптивність, креативність та швидке навчання, ефективність в многозадачності та тривогах.
• Підтверджений досвід успішної роботи в проектах з участю представників різних функцій та третіх сторін з акцентом на командну роботу, співпрацю та комунікацію.
• Досвід роботи з фреймворками для оркестрації робочих процесів, такими як Nextflow, Snakemake, Airflow або AWS Step Functions.

Переважні вимоги 

• Досвід розробки послідовностей NGS з вірусологією, патологією, молекулярною біологією або подібними наборами даних.
• Здатність проектувати та впроваджувати різні програмні платформи за допомогою фреймворка API.
• Знайомство з багаторазовими конвеєрами інтеграції та постійної поставки (CI/CD).
• Досвід роботи з інструментами візуалізації даних, такими як Tableau, Spotfire або Retool.

Місце роботи: Cambridge, MA

Додатково про Flagship Pioneering

Flagship Pioneering виокремлює, створює, фінансує та розвиває кращі у своєму класі компанії у сфері біологічних наук для відновлення здоров'я людей та сталого розвитку. З моменту створення в 2000 році фонд застосовував свій унікальний процес інновацій на основі гіпотез для створення та підтримки понад 100 наукових підприємств, що в результаті створили загальну вартість понад 50 мільярдів доларів. До теперішнього часу Flagship залучила понад 2,2 мільярди доларів капіталу на створення та розвиток своїх проривних компаній, а також понад 18 мільярдів доларів подальших інвестицій від інших установ. Поточну екосистему Flagship складають кращі у своєму класі компанії, включаючи Seres Therapeutics (NASDAQ: MCRB), Indigo Ag, Invaio Sciences, Moderna (NASDAQ: MRNA), Generate Biomedicines, Denali Therapeutics (NASDAQ: DNLI), Senda Biosciences та Foghorn Therapeutics (NASDAQ: FHTX).