Inżynier Danych Bioinformatyki II

Podsumowanie firmy:

Arana Biosciences to jedna z najnowszych firm założonych przez silnik tworzenia przedsiębiorstw Flagship Pioneering, który dał początek firmom takim jak Moderna Inc. i Indigo Ag. Od założenia Flagship w 2000 roku, inicjował i pielęgnował niemal 100 przedsięwzięć naukowych, generując łączną wartość ponad 19 miliardów dolarów, z ponad 500 wydanymi patentami i ponad 50 klinicznymi próbami nowych środków terapeutycznych. Arana Biosciences łączy najnowsze przełomy w biologii molekularnej i roślinnej w celu opracowania nowej platformy technologicznej, która oferuje elastyczne, dedykowane i zrównoważone rozwiązania w sektorze rolniczym.

Inżynier Danych II, Bioinformatyka

Kluczowe obowiązki:

• Projektowanie, rozwijanie i zarządzanie systemami baz danych, umożliwiając biologom samodzielne badanie danych.
• Automatyzacja procesów pobierania danych lub przechowywania danych w elektronicznych notatnikach laboratoryjnych (ELN), takich jak Benchling.
• Współpraca z zespołem naukowców w celu automatyzacji przepływów analizy danych i ustanowienia infrastruktury danych.
• Sporządzanie, przyczynianie się i proaktywne rozpowszechnianie standardów i praktyk inżynierii danych, tworzenia powtarzalnych szablonów i ram, oraz skuteczne wykorzystanie usług i narzędzi chmurowych.
• Komunikowanie spostrzeżeń i postępów naukowemu zespołowi i najwyższemu kierownictwu.

Minimalne kwalifikacje

• B.S. lub M.S. w informatyce lub pokrewnej dziedzinie i co najmniej 3 lata doświadczenia w przemyśle.
• Doświadczenie w pracy z technologiami baz danych, architekturą i zarządzaniem.
• Znajomość języków skryptowych, takich jak Python, R, SQL i narzędzi kontroli wersji.
• Zrozumienie koncepcji i tworzenia dostarczanych rozwiązań projektowych UI.
• Znajomość usług AWS, w tym EC2, S3, RDS, FSx Lustre, Athena, Glue, Lambda, Batch.
• Zrozumienie cyklu życia aplikacji, w tym najlepszych praktyk, takich jak recenzja kodu, testowanie jednostkowe/integracyjne i dokumentacja.
• Umiejętność projektowania i implementacji modeli backendowych przy użyciu logiki i końcówek API dla skomplikowanych przepływów pracy naukowych (np. Benchling).
• Adaptacyjność, kreatywność, szybkie uczenie się, skuteczność w wielozadaniowości i rozwiązywaniu problemów.
• Udowodniona umiejętność skutecznej pracy w zespołach funkcjonalnych oraz z podmiotami zewnętrznymi, z naciskiem na pracę zespołową, współpracę i komunikację.
• Doświadczenie z ramami orkiestracji przepływów pracy, takimi jak Nextflow, Snakemake, Airflow, lub AWS Step Functions.

Preferowane kwalifikacje

• Doświadczenie w procesie tworzenia potoków NGS z wirusologii, patologii, biologii molekularnej lub podobnych zestawów danych.
• Umiejętność projektowania i implementacji różnorodnych platform oprogramowania poprzez framework API.
• Znajomość ciągłego wdrażania/ciągłej integracji (CI/CD).
• Doświadczenie z narzędziami do wizualizacji danych, takimi jak Tableau, Spotfire lub Retool.

Lokalizacja: Cambridge, MA

Więcej o Flagship Pioneering

Flagship Pioneering tworzy, finansuje i rozwija pierwsze w swojej kategorii firmy z branży nauk o życiu, aby transformować zdrowie i zrównoważony rozwój ludzi. Od momentu powstania w 2000 roku, firma za pośrednictwem Flagship Labs, zastosowała unikalny proces innowacji oparty na hipotezach, aby zainicjować i przyspieszyć rozwój ponad 100 projektów naukowych, co zaowocowało łączną wartością ponad 50 miliardów dolarów. Do tej pory, Flagship zainwestował ponad 2,2 miliarda dolarów na rzecz założenia i rozwijania swoich pionierskich firm, a kolejne 18 miliardów dolarów zostało zainwestowane przez innych partnerów. Obecny ekosystem Flagship składa się z pionierskich firm, w tym Seres Therapeutics (NASDAQ: MCRB), Indigo Ag, Invaio Sciences, Moderna (NASDAQ: MRNA), Generate Biomedicines, Denali Therapeutics (NASDAQ: DNLI), Senda Biosciences, i Foghorn Therapeutics (NASDAQ: FHTX).