Ingénieur de Données II, Bioinformatique

Résumé de l'entreprise :

Arana Biosciences est l'une des dernières entreprises créées par le moteur de création de projets de Flagship Pioneering, à l'origine de sociétés comme Moderna Inc. et Indigo Ag. Depuis la création de Flagship en 2000, la firme a initié et favorisé le développement de près de 100 projets scientifiques, générant une valeur globale de plus de 19 milliards de dollars, plus de 500 brevets délivrés et plus de 50 essais cliniques pour de nouveaux agents thérapeutiques. Arana Biosciences intègre les derniers développements en biologie moléculaire et en biologie des plantes pour créer une nouvelle technologie de plateforme qui permet des solutions adaptatives, ciblées et durables en agriculture.

Ingénieur Données II, Bioinformatique

Responsabilités clés :

• Concevoir, créer et gérer des systèmes de bases de données qui permettent aux biologistes d'étudier les données de manière indépendante.
• Automatiser les flux de travail pour la récupération ou le stockage de données dans des cahiers de laboratoire électroniques (ELNs), tels que Benchling.
• Collaborer avec une équipe de scientifiques pour aider à automatiser les pipelines d'analyse de données et construire une infrastructure de données.
• Définir, contribuer à, et communiquer proactivement les normes et pratiques d'ingénierie de données établissant des modèles et des cadres répétables et un usage efficace de services et outils en nuage.
• Communiquer les idées et les progrès à l'équipe scientifique et à la direction exécutive.

Qualifications minimales

• B.S. ou M.S. en informatique ou domaine connexe et plus de 3 ans d'expérience dans l'industrie
• Expérience approfondie avec les technologies de bases de données, l'architecture et la gestion.
• Expérience en programmation dans des langages de script tels que Python, R, SQL, et outils de gestion de version.
• Compréhension de la conception et la création de livrables de conception d'interface utilisateur.
• Connaissance pratique des services AWS, y compris EC2, S3, RDS, FSx Lustre, Athena, Glue, Lambda, Batch.
• Connaissance du cycle de vie des applications, y compris les meilleures pratiques telles que la revue de code, les tests d'intégration/ unitaires, et la documentation.
• Capacité à concevoir et mettre en œuvre des modèles backend en utilisant la logique et les points de terminaison API pour des flux de travail scientifiques complexes/entités (c'est-à-dire. Benchling).
• Adaptatif, créatif, et un apprenant rapide, efficace dans la gestion de multiples tâches et le dépannage.
• Capacité démontrée à travailler avec succès dans des équipes transversales et tierces, avec un accent sur le travail d'équipe, la collaboration et la communication.
• Expérience avec les cadres d'orchestration de flux de travail tels que Nextflow, Snakemake, Airflow ou AWS Step Functions.

Qualifications préférées

• Expérience de développement de pipeline NGS avec la virologie, la pathologie, la biologie moléculaire, ou des ensembles de données similaires.
• Capacité à concevoir et mettre en œuvre une variété de plateformes logicielles à travers le cadre API.
• Familiarité avec les pipelines d'intégration continue/déploiement continu (CI/CD).
• Expérience avec les outils de visualisation de données, tels que Tableau, Spotfire, ou Retool.

Localisation : Cambridge, MA

Plus de détails sur Flagship Pioneering

Flagship Pioneering conçoit, crée, fournit des ressources et développe des entreprises de sciences de la vie avant-gardistes pour transformer la santé humaine et la durabilité. Depuis son lancement en 2000, la société a, par son unité Flagship Labs, appliqué son processus unique d'innovation basé sur des hypothèses pour créer et promouvoir plus de 100 entreprises scientifiques, générant une valeur globale de plus de 50 milliards de dollars. À ce jour, Flagship a déployé plus de 2,2 milliards de dollars en capital pour la création et la croissance de ses entreprises pionnières, aux côtés de plus de 18 milliards de dollars d'investissements supplémentaires d'autres institutions. L'écosystème actuel de Flagship comprend des entreprises transformatrices, dont Seres Therapeutics (NASDAQ: MCRB), Indigo Ag, Invaio Sciences, Moderna (NASDAQ: MRNA), Generate Biomedicines, Denali Therapeutics (NASDAQ: DNLI), Senda Biosciences et Foghorn Therapeutics (NASDAQ: FHTX).