Post Doctoral Fellow (Computational Biology/Computer Science)

Résumé du poste :

Nous recherchons un Chargé de recherche postdoctoral hautement qualifié spécialisé en Biologie Computationnelle ou en Informatique pour rejoindre notre laboratoire de Biologie Reproductive à Sidra Medicine. Ce poste fait partie de notre Division de la Santé Reproductive et Périnatale, se concentrant sur les aspects fondamentaux et translationnels de la biologie reproductive. Notre recherche interdisciplinaire vise à découvrir de nouveaux mécanismes régulant la gamétogenèse, la fertilisation et le développement précoce, en utilisant des systèmes modèles incluant le poisson-zèbre, les souris et les humains.

Notre objectif ultime est de traduire les découvertes scientifiques fondamentales en outils innovants pour les patients en fécondation in vitro (FIV). Le candidat retenu collaborera étroitement avec le programme de FIV et les spécialistes de la fertilité à Sidra Medicine. En utilisant des approches multidisciplinaires, vous identifierez de nouveaux gènes et variantes impactant les mécanismes reproductifs clés.

Responsabilités principales :

• Effectuer des analyses complètes de données génomiques, transcriptomiques (en masse et à cellule unique), épigénétiques et protéomiques.
• Collaborer avec l'équipe de la plateforme centrale et les responsables de la bioinformatique.
• Développer de nouvelles méthodes computationnelles et pipelines d'analyse utilisant des outils tels que Bpipe, Nextflow et Snakemake.
• Créer des scripts personnalisés en R/Python pour l'analyse aval et la visualisation des données.
• Réaliser des analyses intégratives de données multi-omiques.
• Rédiger et publier des articles de haute qualité dans des revues à comité de lecture.
• Fournir des mises à jour régulières sur l'état du projet.
• Collaborer avec le personnel scientifique principal pour développer expertise et connaissances.
• Former les technologues médicaux et les cliniciens sur les avancées du domaine.
• Participer au développement de carrière et aux processus de revue des postdocs.

Qualifications du candidat :

Éducation :

Essentielle : Doctorat dans un domaine pertinent.

Préférée : Doctorat en sciences de la vie, informatique, bioinformatique ou domaines connexes.

Expérience :

Essentielle :

• Capacité avérée à mener des recherches indépendantes.
• Fortes compétences organisationnelles et capacité à travailler en équipe.
• Expérience de recherche dans un centre de santé académique ou une université à haute activité de recherche.
• Bon dossier de publications scientifiques et solides références.

Préférée :

• Solide compréhension des concepts biologiques.
• Expérience approfondie de l'analyse génomique.
• Compétences en analyse transcriptomique et autres données NGS.
• Connaissances solides en statistiques, y compris en génétique statistique.
• Maîtrise de la programmation en Python et/ou R.
• Expérience avec les environnements HPC, commandes Linux et systèmes de contrôle de version comme Git.
• Familiarité avec les outils de gestion de pipeline (Bpipe, Snakemake, Nextflow).
• Expérience préalable en génétique des populations, apprentissage automatique, analyse multi-omique ou analyse de données publiques.
• Deux publications ou plus en premier auteur dans des revues internationales à comité de lecture.

Compétences et aptitudes spécifiques au poste :

• Expertise en méthodes de recherche scientifique et évaluation des résultats.
• Capacité à rester à jour avec les tendances et développements actuels dans le domaine.
• Forte capacité intellectuelle inspirant respect et crédibilité en milieu académique.
• Excellentes compétences en collaboration et travail indépendant.
• Cap